Buca Ortaokulu 1868 yılında Baltacı adında bir Levanten vatandaşımız tarafından yaptırılan ve halen Buca Lisesi olarak hizmet veren tarihi binada 1930-1931 yılında Eğitim-Öğretime başlamıştır.
Anadolu´nun işgali yıllarında bir süre hastahane olarak kullanılan bu yapı, daha sonra Yunan General Venizolos´un karargahı şeklinde değerlendirilmiştir.
İzmir´in kurtuluşundan sonra da Atatürk burada bir gece konaklamış, bu nedenle "GAZİ KÖŞKÜ" adıyla ünlenmiştir.
1966 yılına kadar Buca Ortaokulu adıyla hizmet veren okulumuz 3. binanın yapımıyla 1966-1967 öğretim yılında Buca Lise´sine dönüşmüştür.Halen içinde bulunduğumuz bina 1975-1976 döneminde Buca Lisesi bünyesine katılmıştır.
1989-1990 ders yılına kadar ortaokul ve lise olarak iç içe olan okulumuz 1990 yılından itibaren bağımsız ortaokul olarak ve Necip Fazıl Kısakürek ortaokulu adıyla eğitim öğretime devam etmiştir.
1993-1994 öğretim yılına kuruluş adı olan Buca Ortaokulu olarak başlamıştır
1997-1998 öğretim yılında Buca İlköğretim Okulu ismini almıştır.

2012-2013 öğretim yılında tekrar Buca Ortaokulu adını almıştır.